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「我們的 NVIDIA 平台終結了傳統蛋白質晶體成像的障礙。我們相信 NVIDIA 在繪圖領域持續創新結合其使用者親善的開發工具能帶來更快速的處理,而無須動到任何一行程式碼。這套功能強大的解決方案將有助於研究室以更有效率、更自動化的方式找到蛋白質晶體,並且終將援助我們更快速研發能夠改善生活與拯救生命的新藥。」

Dominique Toppani, Axygen Bioscience

 
Discover
Axygen Biosciences Axygen Biosciences

Challenge

Crystallized M. tuberculosis protein
晶體化的 M. 結核菌蛋白質
蛋白質是由氨基酸構成的分子;身體需要蛋白質才能正常運作。分析蛋白質的 3D 結構能夠讓我們深入認識蛋白質的生理功能,並有助於研究更有效率的藥物與藥劑。晶體成像是我們探索蛋白質構造的主要方法。在晶體成像時,蛋白質被強迫成為晶體,這樣的過程需要數以千計的實驗來達成。傳統上,這些實驗都是以肉眼來篩選並偵測蛋白質晶體的。




Solution

Microscopic protein crystalline structures
顯微鏡底下的蛋白質晶體構造
研究人員目前正計畫運用圖像與影像處理技術將此一過程自動化。Axygen Biosciences 發展出進階的影像處理演算方式,在四百萬像素的圖像上運用數十道快速傅立葉變換(FFT)、相互關聯處理與其他非線性過濾。因為處理器速度的限制與專用系統昂貴的費用,此種演算方式向來難以實行。為了解決這些問題,Axygen Biosciences 採用了 NVIDIA,將處理時間減少至十分之一。功能強大的 NVIDIA SLI™ 技術 (雙核心與四核心) 提供額外的 1.7 至 3.5 倍加速,進而達成幾近即時的運算。

Impact

Axygen Bioscience 的 Dominique Toppani 表示:「我們的 NVIDIA 平台終結了傳統蛋白質晶體成像的障礙。我們相信 NVIDIA 在繪圖領域的持續創新結合其使用者親善的開發工具能帶來更快速的處理,無須動到任何一行程式碼。這套功能強大的解決方案將有助於研究室以更有效率、更自動化的方式找到蛋白質晶體,並終將幫助我們更快速研發出改善生活與拯救生命的新藥。」

如需更多資訊,請前往: http://www.axygenbio.com

圖片由 Lawrence Livermore National Laboratory 的 Brent Segelke 提供。